home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BBS in a Box 15 / BBS in a box XV-1.iso / Files / Educ / Higher Ed / G-M / MacAtoms 3.3.0.sit / About MacAtoms 3.3.0 next >
Encoding:
Text File  |  1993-10-24  |  4.2 KB  |  84 lines  |  [TEXT/ttxt]
  1.                                       About MacAtoms 3.3.0
  2.  
  3. MacAtoms is a program for making realistic pictures of atomic
  4. structures. The program is designed to give you interactive control over
  5. the parameters that determine the appearance of the picture. For
  6. example, you can change the viewpoint by just moving the mouse and
  7. observing the effect. You can also change the radius and color of groups
  8. of atoms by moving the mouse.
  9.  
  10. MacAtoms lets you select atoms or groups of atoms using the usual point and 
  11. click technique. It also lets you select atoms based on various criteria, 
  12. such as the type of atom or the distance between an atom and its nearest 
  13. neighbors. The atoms that are selected can be moved independently of the 
  14. other atoms. You can use this feature to make stereo pairs that help you 
  15. visualize your structure. You can hide the atoms that are selected, or move 
  16. them aside in order to see inside a structure. 
  17.  
  18. MacAtoms lets you combine selected atoms into groups and then combine
  19. the groups to make more complex groups. You can use this to build
  20. molecules out of simpler components or to organize the atoms so that
  21. clicking on one atom of a group causes the entire group to be selected.
  22.  
  23. MacAtoms supports multiple windows, and it is possible to cut and paste
  24. atoms between windows. The program takes its data for each window from a
  25. simple text file that describes the atom positions, radii, and colors.
  26. Each window can have a separate data file. You can use these features in
  27. many ways. For example, you can compare similar data sets by displaying
  28. each one in a different window. Or, you can have one window that
  29. contains a library of useful molecules, and another window that contains
  30. a complex structure built from the molecules that you copy from the first 
  31. window.
  32.  
  33. MacAtoms places essentially no limits on the number of windows, the
  34. number of atom types, the number of atoms of each type, or the number of
  35. groups of atoms, beyond the obvious limitations imposed by memory. While
  36. it is at its best on the Macintosh II line of computers, the program can
  37. also generate realistic pictures on older Macintoshes that do not
  38. support gray scale and color displays, such as the Macintosh 512K or SE.
  39. However you will be a bit constrained for memory on the smaller
  40. machines.
  41.  
  42. MacAtoms can produce hardcopy prints on any printer, including color
  43. printers. The print quality may not be very satisfactory on low
  44. resolution printers such as the ImageWriter, but on most printers the
  45. images are quite realistic. MacAtoms can also drive several other types
  46. of recording devices, such as video tape recorders and optical disks.
  47. MacAtoms can be made to run freely, reading data from a data file and
  48. plotting the results on a recording device, all without human
  49. intervention. You can use this technique to make movies.
  50.  
  51. The manual for MacAtoms was written using Microsoft Word. You should also 
  52. be able to read the manual in other word processors provided they can read 
  53. Microsoft Word files. To do that, start your word processor, and then 
  54. select the Open menu item. Look for an Options button in the dialog that 
  55. lets you select what type of document to open. 
  56.  
  57. This version of MacAtoms is being offered as "Freeware", which means you
  58. don't have to pay me for it unless you just want to. However, the
  59. program is not in the public domain, and I retain all rights to it. I am
  60. encouraging users to distribute the program widely, subject to a few
  61. restrictions.  If you do use MacAtoms, send me a postcard so I can 
  62. keep you up to date when new versions come out.
  63.  
  64. Version 3.3.0 is primarily a feature release. Some of the new features 
  65. include selecting atoms by type, by distance from the origin, and by 
  66. distance to near neighbors; hiding and unhiding atoms; creating new atoms 
  67. and atom types interactively; undoing and repeating most commands; and many 
  68. others. There are a few bugfixes too. For more information about changes in 
  69. this version, read the release notes in the manual. 
  70.  
  71.  
  72.     Hilary D. Jones
  73.     364 Princeton Ln.
  74.     Danville CA 94526
  75.     510-837-8958
  76.  
  77.     Sandia National Laboratories
  78.     PO Box 969, Department 1952
  79.     Livermore CA 94551-0969
  80.     510-294-2892
  81.  
  82.     CompuServe:      74666,167
  83.     ARPANET:  hilary@california.sandia.gov
  84.